O Conselho Deliberativo é o órgão superior de administração do SAMAE, com função normativa. Ele é composto por 12 representantes de órgãos, entidades ou classes da comunidade timboense indicados entre pessoas, cujo conhecimento técnico ou científico tenha relação com as finalidades da instituição. O mandato é de dois anos, sendo que os Conselheiros não são remunerados, pois o exercício do mandato é considerado serviço público relevante.

Entre as atribuições do Conselho Deliberativo está a autorização e criação de órgãos, comissões ou subcomissões, de caráter temporário e para finalidades específicas, bem como as demais atribuições elencadas no Artigo Art. 11 da Lei Complementar nº 212/2001 que institui o Serviço Autônomo Municipal de Água e Esgoto – SAMAE, que são:

I – apreciar e deliberar sobre o Plano Anual e Plurianual de Ação, relatório anual e prestação de contas;

II – estabelecer a política de prioridades nas atividades do SAMAE, e deliberar, a pedido da Diretoria, sobre programas de trabalho e relatório de atividades;

III – examinar e aprovar o Regimento Interno do SAMAE, submetendo-o à aprovação do Prefeito;

IV - autorizar a formação de órgãos, comissões e subcomissões de caráter temporário e com finalidades específicas;

V - avaliar o recebimento de doações, legados, subvenções, bem como decidir sobre a conveniência de alienação de bens móveis e imóveis;

VI - deliberar sobre convênios, contratos, acordos, programas, projetos ou assuntos de interesse da Entidade, mediante indicação do Presidente ou a pedido da Diretoria Executiva;

VII - deliberar sobre alteração ou reforma dos Estatutos, submetendo-as à apreciação do Chefe do Poder Executivo;

VIII - resolver os casos omissos no Estatuto ou Regimento Interno;

IX - zelar pelo prestígio do SAMAE, sugerindo medidas para resguardá-la;

X - autorizar a Diretoria a efetuar operações de créditos, obedecidas as formalidades legais;

XI – designar data, local, horário e ordem do dia das reuniões ordinárias e extraordinárias, bem como lavrar o registro em ata de suas reuniões e dos resultados dos exames que proceder, transcrevendo os pareceres que emitir.

A atual composição do Conselho, foi designada pela Portaria nº 526, de 30 de novembro de 2017, para o mandato de 2017 a 2019.